Postdoctoraal onderzoeker in Tumor-microbiome Onderzoek

2 maanden geleden


Leiden, Nederland LUMC Voltijd

Wat ga je doen?

In dit project zal je microben in tumorweefsels ruimtelijk in kaart brengen en de moleculaire interactie tussen microben en gastheer analyseren door ruimtelijke en bulk-omics data te genereren en te integreren over verschillende modaliteiten. Je zult samenwerken met andere leden van ons interdisciplinaire team, evenals met externe samenwerkingspartners van het LUMC en daarbuiten die ons interesse delen in ruimtelijke omics (Leiden, NL: Noel de Miranda; Heidelberg, DE: Jan Korbel, Mathias Heikenwaelder, Julio Saez Rodriguez, Jens Puschhof, Eran Elinav; Stockholm, SE: Stefania Giacomello, Eduardo Villablanca).

Wat neem je mee?

Je hebt een PhD in een biomedische discipline. Enthousiasme voor high-throughput benaderingen en kwantitatieve analyse. Een sterke interesse om ambitieuze onderzoeksprojecten aan te gaan om een beter begrip te krijgen van de rol van microben in tumorontwikkeling en patiëntenresultaten. Aantoonbare ervaring in een van de volgende gebieden: Fluorescentiemicroscopie / ruimtelijke omics-technologieën: Ervaring met fluorescentiemicroscopie, kennis van moderne ruimtelijke technologieën (inclusief verschillende multiplex FISH-benaderingen), en praktische ervaring in microbiologie en/of celkweek. Bij voorkeur ervaring met geautomatiseerde beeldverwerving, het ontwerpen/gebruiken van microfluïdische apparaten, en/of andere laboratoriumautomatisering en benaderingen met hoge doorvoer. Interesse om deze technieken toe te passen om bacteriële virulentie, adhesie en invasiemechanismen te karakteriseren die relevant zijn voor kanker. Bio-imaging en ruimtelijke gegevensanalyse: Theoretische kennis en praktische computationele vaardigheden (bij voorkeur met Python) in kwantitatieve bio-imaging of ruimtelijke omics-analyse, inclusief beeldsegmentatie, object/punt herkenning, en het ontwerpen/decoderen van fluorescentiebarcodes. Uitzien naar het gebruik van deze vaardigheden voor de integratieve analyse van nieuwe datamodaliteiten die microbiële en gastheerkenmerken vastleggen, met als doel inzicht te verkrijgen in moleculaire interacties tussen gastheer en microbe.Biostatistiek en machine learning-toepassingen in microbiome-onderzoek: Grondig begrip en praktische ervaring in het analyseren van sequencing of andere omics-gegevens met statistische en machine learning-methoden (idealiter inclusief metagenomics of andere microbiomegegevens). Enthousiasme om dergelijke benaderingen toe te passen in uitdagende microbiome-projecten om te begrijpen hoe microben interageren met de gastheer en hoe microbiële invloeden tumorprogressie en behandelingresultaten beïnvloeden.

Wat bieden we jou?

Grensverleggend beter worden; dat is onze missie. Dit geldt niet alleen voor de zorg, maar ook voor onze medewerkers. Om te kunnen blijven leren en ontwikkelen bieden wij interne opleidingen en bijscholing aan. Daarnaast heb je recht op een eindejaarsuitkering (8,3%), vakantiegeld, fietsregeling en sportbudget. Ook ben je als medewerker van het LUMC aangesloten bij het ABP pensioenfonds. Dit betekent dat maar liefst 70% van je pensioenpremie betaald wordt door het LUMC en je daardoor netto meer salaris over houdt. Wel zo fijn

Waar ga je werken?

Het LUMC, gevestigd in Leiden, Nederland, is een academisch medisch centrum voor patiëntenzorg, onderzoek en onderwijs, met als doel de uitdagingen van de gezondheidszorg van morgen aan te gaan. Het heeft een sterke focus op onderzoek, waarbij fundamenteel onderzoek naar ziekteveroorzakende mechanismen wordt verbonden en gecombineerd met patiëntgerichte studies op gebieden zoals oncologie, regeneratieve geneeskunde en volksgezondheid. Het LUMC beschikt over onderzoeksfaciliteiten met mogelijkheden voor meerdere toepassingen. De combinatie met klinische en maatschappelijke programma's maakt baanbrekend onderzoek en innovatie mogelijk op het gebied van fundamentele en toegepaste wetenschap.Je komt te werken op een afdeling waar onderzoekers uit de microbiologie, parasitologie, immunologie en infectieziekten samenwerken over disciplines heen aan zowel fundamentele als translationele projecten. Je zult lokale samenwerkingsverbanden buiten LUCID opzetten met veel klinische afdelingen van het LUMC, waaronder pathologie, oncologie en gastro-enterologie, evenals met bioinformatici, datawetenschappers en microbiologen van het LUMC, LU (IBL), en de Technische Universiteit Delft.

Waar staan wij voor?

Onze gezondheid is van onschatbare waarde. Meer dan in enig ander beroep, kun je in de gezondheidszorg de hele diversiteit in de mensheid in de volle breedte waarderen. Het LUMC, als academisch medisch centrum, omarmt die diversiteit volledig Wij streven naar de hoogste kwaliteit op het gebied van gezondheidszorg, onderwijs en (internationaal) onderzoek. Wij willen een creatieve en inspirerende werkplek zijn. Het is van essentieel belang dat iedereen zich thuis, veilig en erkend voelt. Daarom was het LUMC dan ook het eerste academisch medisch centrum dat partner werd bij . Ons actieve netwerk, LUMC Pride, zet zich in voor optimale inclusiviteit en diversiteit binnen onze organisatie. Ongeacht herkomst, geslacht, uiterlijk, leeftijd, identiteit, geaardheid of geloof, ben je een waardevol onderdeel van onze organisatie. Samen zijn wij LUMC.

Meer informatie

Als postdoc onderzoeker bedraagt je salaris minimaal € ,- en maximaal € ,- (schaal 10, CAO UMC). Deze bedragen zijn op basis van een fulltime dienstverband. De duur van het dienstverband is vier jaar. Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld. 

  • Leiden, Nederland LUMC Voltijd

    Ben jij een (bijna) gepromoveerde onderzoeker met een passie voor implementatie-wetenschap en eerstelijnszorg, vooral gericht op jeugd en gezin? Wil jij actief bijdragen aan projecten zoals Samen voor Beter, Doing what Works for Children en andere initiatieven die zich richten op het verbeteren van zorginterventies voor kinderen, jongeren en hun ouders? Heb...


  • Leiden, Nederland Universiteit Leiden Voltijd

    Vacaturenr. 14835 Functie-categorie Omvang (fte) 0,6 Extern/intern Extern Locatie Leiden Geplaatst op 30 april 2024 Sluitingsdatum 24 mei 2024 **Postdoc-onderzoeker bij het onderzoek “Exploring Social Identity in Autism” (0,6 fte)** Ben je enthousiast, nieuwsgierig, (bijna) gepromoveerd, en wil je bijdragen aan onderzoek op het snijvlak van...


  • Leiden, Nederland LUMC Voltijd

    Wat ga je doen? Als onderzoeker op de afdeling Reumatologie ben jij verantwoordelijk voor de opzet en voortgang van klinisch wetenschappelijk onderzoek. In dit project ontwikkel je een ziekteactiviteit maat voor mensen met gewrichtsklachten en een verhoogde kans om reumatoïde artritis te krijgen. Een behandeling in mensen met reuma heeft als doel om...


  • Leiden, Nederland Universiteit Leiden Voltijd

    Postdoc-onderzoeker bij het onderzoek “Exploring Social Identity in Autism” (0,6 fte) Ben je enthousiast, nieuwsgierig, (bijna) gepromoveerd, en wil je bijdragen aan onderzoek op het snijvlak van wetenschappelijke en maatschappelijke impact, met een focus op de ontwikkeling van sociale identiteit bij jongeren en jongvolwassenen met autisme? Dan...

  • Ontwerpgerichte Onderzoeker

    1 maand geleden


    Leiden, Nederland Hogeschool Leiden Voltijd

    De faculteit Sociaal Werk & Toegepaste Psychologie van Hogeschool Leiden zoekt een Ontwerpgerichte Onderzoeker Project Life Skills (Levensvaardigheden) - Lectoraat Ouderschap & Ouderbegeleiding (0,4 - 0,6 fte). **Ben jij begaan met het mentale welzijn van ouders en jongeren? Krijg je energie van het ontwerpen van interventies en het doen van onderzoek naar...

  • Arts-onderzoeker Neurologie

    4 weken geleden


    Leiden, Nederland LUMC Voltijd

    Wat ga je doen? Als arts-onderzoeker werk je samen met ons onderzoeksteam aan het uitvoeren en coördineren van verschillende klinische trials. Dit varieert van grote observationele studies (Enroll-HD, IDEA-FAST) tot meerdere medicatie onderzoeken (PIVOT-HD, SELECT-HD, VICO-SCA), waarbij lichamelijk/neurologisch onderzoek en lumbaal puncties worden...

  • Docent-Onderzoeker

    2 maanden geleden


    Leiden, Nederland Hogeschool Leiden Voltijd

    De functie bestaat uit 0,4 fte onderzoek en 0,1 fte onderwijs. Functie-eisen De docent-onderzoeker die wij zoeken is enthousiast, ambitieus en: Is afgestudeerd als fysiotherapeut en heeft bij voorkeur een aanvullende opleiding op masterniveau afgerond; Heeft een brede kijk op het vak Fysiotherapie waarin gedrag, gezondheid en (wijk)...


  • Leiden, Nederland LUMC Voltijd

    Wat ga je doen? Als onderzoeker speel je een cruciale rol in een landelijke gerandomiseerde studie naar antibiotische behandelopties voor patiënten met een prothese infectie. Je belangrijkste verantwoordelijkheden omvatten het includeren van patiënten in de studie en het nauwkeurig registreren van verzamelde data in een centrale database. Daarnaast...

  • Junior onderzoeker

    4 weken geleden


    Leiden, Nederland Topaz Voltijd

    Ga jij bij Topaz Overduin aan de slag met de implementatie van een app voor mensen met de ziekte van Huntington? Als junior onderzoeker houd jij je bezig met de verbetering en implementatie van de Huntington Support App. Deze webapp is ontwikkeld in een internationaal samenwerkingsverband, met en voor mensen met (het gen voor) de ziekte van Huntington...


  • Leiden, Zuid-Holland, Nederland Universiteit Leiden Voltijd

    Op het Instituut van Geschiedenis van de Universiteit Leiden wordt in het kader van een NWA-project de komende jaren transdisciplinair onderzoek verricht naar de eenzaamheid van mensen met een licht verstandelijke beperking. Voor het historisch onderzoek binnen dit project zoekt het Instituut een promovendus (PhD kandidaat).Startdatum van het project is 1...

  • PhD-kandidaat MReye

    1 maand geleden


    Leiden, Nederland LUMC Voltijd

    Wat ga je doen? Als promovendus bij de MReye onderzoeksgroep binnen de afdelingen Oogheelkunde, Radiologie en Radiotherapie doe je onderzoek binnen het grotere COMPOSE project. In dit project werken we aan het combineren van optische, MRI- en histopathologische gegevens van patiënten met oogkanker, met als doel de behandeling meer gepersonaliseerd...


  • Leiden, Nederland LUMC Voltijd

    Wat ga je doen? Als arts-onderzoeker sta jij aan het roer van innovatief pancreasonderzoek. Binnen dit project bieden we zowel een klinisch PhD-traject als een technisch PhD-traject aan, in nauwe samenwerking met het Laboratorium voor Klinische en Experimentele Beeldverwerking. In deze functie ben jij verantwoordelijk voor het coördineren van het...


  • Leiden, Nederland Universiteit Leiden Voltijd

    Het instituut Pedagogische Wetenschappen van de Faculteit der Sociale Wetenschappen van de Universiteit Leiden is op zoek naar een Promovendus voor het onderzoek: ‘Leerkracht Sensitiviteit’ (1.0 fte) Ben jij geïnteresseerd in leerkracht-leerling interactie en vind je het leuk om samen met ons een methodologische uitdaging aan te gaan? Dan zoeken...


  • Leiden, Nederland LUMC Voltijd

    Wat ga je doen? Je verricht promotieonderzoek naar de erfelijke hersenvaatziekte CADASIL en andere genetische aandoeningen van de hersenvaten. De werkzaamheden zijn interdisciplinair en omvatten klinische studies met patiënten, genetica, radiologie, neurologie en pathologie. Jouw onderzoek richt zich op het identificeren van nieuwe ziektegenen en de...


  • Leiden, Zuid-Holland, Nederland Universiteit Leiden Voltijd

    Het instituut Pedagogische Wetenschappen van de Faculteit der Sociale Wetenschappen van de Universiteit Leiden is op zoek naar eenPromovendus voor het onderzoek: 'Leerkracht Sensitiviteit' (1.0 fte)Ben jij geïnteresseerd in leerkracht-leerling interactie en vind je het leuk om samen met ons een methodologische uitdaging aan te gaan? Dan zoeken wij jou voor...

  • Postdoc vaccinontwikkeling

    2 weken geleden


    Leiden, Nederland LUMC Voltijd

    Wat ga je doen? Als postdoctoraal onderzoeker ben je betrokken bij projecten die gericht zijn op de adjuvantering en formulering van kankervaccins om de immunotherapieën te optimaliseren. Daarnaast richt je je op de ontwikkeling van moleculair gedefinieerde kankervaccins. Je ontwerpt de chemische synthese van peptide-adjuvans-conjugaten om de...

  • Phd-kandidaat Nierziekten

    1 maand geleden


    Leiden, Nederland LUMC Voltijd

    De onderzoeksgroep Nierziekten van het LUMC is op zoek naar een gemotiveerde promovendus om ons Orgaan Perfusie laboratorium te versterken. Ben jij een basisarts met een sterke interesse in (bio)medisch onderzoek op het gebied van nierziekten en regeneratieve geneeskunde? Dan is dit 4-jarige translationele PhD-traject misschien iets voor jou! **Wat ga je...

  • Redacteur wetenschap

    4 weken geleden


    Leiden, Zuid-Holland, Nederland Universiteit Leiden Voltijd

    Ben jij een redacteur met een passie voor goede teksten en aansprekende beelden? En weet je als geen ander hoe je de organisatie betrekt en ondersteunt met goede wetenschapsredactie? Kom dan ons team versterken De afdeling Marketing en Communicatie van de Faculteit der Rechtsgeleerdheid van de Universiteit Leiden zoekt per 1 juli 2024 ter vervanging van...

  • Marktonderzoeker

    1 maand geleden


    Leiden, Nederland Qompas Voltijd

    Gepubliceerd op 1 mei 2024- Deadline: 16 mei 2024Op zoek naar een functie met impact? Word onderzoeker bij Qompas en werk voor opdrachtgevers als Universiteit Leiden, ABN AMRO en nog veel meer! Op zoek naar een functie met impact en maatschappelijk nut? Word onderzoeker bij Qompas en werk voor opdrachtgevers als Universiteit Leiden, ABN AMRO en nog veel...


  • Leiden, Nederland LUMC Voltijd

    Wat ga je doen? Als postdoc in onze groep speel je een belangrijke rol bij het uitvoeren en coördineren van genetische analyses. Jouw belangrijkste verantwoordelijkheid is het opzetten van een analytisch kader voor het bestuderen en identificeren van nieuwe genetische aanleggerelateerd aan reumatische ziekten. Dit kader is instrumenteel bij het...