Bioinformatics Data Engineer

2 weken geleden

Utrecht, Utrecht, Nederland Genmab Voltijd

At Genmab, we're committed to building extra[not]ordinary futures together, by developing antibody products and pioneering, knock-your-socks-off therapies that change the lives of patients and the future of cancer treatment and serious diseases. From our people who are caring, candid, and impact-driven to our business, which is innovative and rooted in science, we believe that being proudly unique, determined to be our best, and authentic is essential to fulfilling our purpose.

The role

As Bioinformatics Data Engineer you will contribute to the mission of the global data engineering function and be responsible for many aspects of data including architecture, access, classification, standards, integration, pipelines and visualization. Although your role will involve a diverse set of data-related responsibilities, your expertise will be on automated processing of mostly biological research data for the Discovery Department and, particularly, for the Discovery Data Scientists. You will leverage your expertise in pipeline development with scientific data objects to model and catalog large amounts of data with corresponding metadata layers.

You will work closely with data scientists to determine what metadata will be required to retrieve data and how to capture the information in an automated way. Your ultimate goal will be to place data at the fingertips of stakeholders and enable science to go faster. You will join an enthusiastic, fast-paced and explorative global data engineering team.

The Data Products team supports Genmab's mission by helping researchers use data at its full potential Particularly, the Utrecht team supports the Discovery department with the ingestion, flow, and processing of biological and operational data. We work closely with researchers, managers, IT staff and data scientists to find solutions together that fit Genmab's data needs.

The Data Products team is spread between Princeton (USA), Copenhagen (Denmark) and Utrecht (The Netherlands). This position would be joining the six data engineers currently working in Utrecht (2-3 days onsite expected).

Responsibilities

  • Design, develop and deploy reproducible data pipelines using cloud-native tools. All our pipelines use infrastructure as code, have automated tests and are as re-usable and reproducible as possible.
  • Connect with collaborators (scientists, project managers, etc.) to translate their needs and questions into technical requirements. We then use the requirements to build data pipelines and visualizations that are meaningful, comprehensible, and practical for them.
  • Every data engineer has projects to lead and others in which there are only smaller contributions.
  • Generate comprehensive documentation of the data products developed, both for technical and non-technical users.
  • Promote good (coding/data) practices and lead by example.

Requirements

  • MS/PhD or equivalent experience in Computer Science, Bioinformatics, or related field.
  • 3+ years of demonstrated working experience as a data engineer.
  • Experience with data pipeline design and creation is a must. The pipelines should use good coding practices and the right tool for the job. Experience with ETL jobs (e.g. AWS Glue, Databricks jobs, AWS Lambda) and orchestrators (e.g. AWS StepFunctions) is desirable.
  • Solid experience in database design (partitions, schemas, choosing database type, etc.) and querying languages (SQL, pyspark or similar) is a requirement. Experience with delta lake (delta tables) is a plus.
  • Strong experience writing Python code (including OOP, automated testing, etc.). Experience using R is a plus.
  • Basic knowledge of FAIR principles and GXP rules for data handling is also advantageous but not rigorously required.
  • Although understanding biological data (experimental and clinical data) is not a strong requirement, it could make the candidate more efficient in the job.
  • Experience using version control system (git) in collaborative projects is required. Knowledge in CI/CD pipelines is an advantage.
  • Needs good communication skills in the English language, which is the primary language spoken at Genmab.

About You

  • You are passionate about our purpose and genuinely care about our mission to transform the lives of patients through innovative cancer treatment
  • You bring rigor and excellence to all that you do. You are a fierce believer in our rooted-in-science approach to problem-solving
  • You are a generous collaborator who can work in teams with diverse backgrounds
  • You are determined to do and be your best and take pride in enabling the best work of others on the team
  • You are not afraid to grapple with the unknown and be innovative
  • You have experience working in a fast-growing, dynamic company (or a strong desire to)
  • You work hard and are not afraid to have a little fun while you do so

Locations

Genmab leverages the effectiveness of an agile working environment, when possible, for the betterment of employee work-life balance. Our offices are designed as open, community-based spaces that work to connect employees while being immersed in our state-of-the-art laboratories. Whether you're in one of our collaboratively designed office spaces or working remotely, we thrive on connecting with each other to innovate.

  • Bioinformatics Educator

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland UMC Utrecht Voltijd

    Are you a bioinformatician with a passion for education? Do you have a strong drive to teach, develop education and to work in a vibrant multidisciplinary research community? If so, we have the perfect opportunity for youElke dag de zorg en de gezondheid van mensen verbeterenGoede arbeidsvoorwaardenJezelf continu blijven ontwikkelen vinden we belangrijkDit...

  • Intern, Translational Data Science

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Genmab Voltijd

    At Genmab, we're committed to building extra[not]ordinary futures together, by developing antibody products and pioneering, knock-your-socks-off therapies that change the lives of patients and the future of cancer treatment and serious diseases. From our people who are caring, candid, and impact-driven to our business, which is innovative and rooted in...

  • Research Officer in Data Science for Advanced Therapies at the Department of Pharmacology and Pharmacy

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland HKU Voltijd

    Research Officer in Data Science for Advanced Therapies at the Department of Pharmacology and PharmacyWe are excited to announce an opportunity to join the Laboratory of Drug Delivery, Nanomedicine & Advanced Therapeutics at the Department of Pharmacology and Pharmacy, LKS Faculty of Medicine. As a Research Officer in data science/bioinformatics/artificial...

  • Intern, Translational Data Science

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Genmab Voltijd

    At Genmab, we're committed to building extra[not]ordinary futures together, by developing antibody products and pioneering, knock-your-socks-off therapies that change the lives of patients and the future of cancer treatment and serious diseases. From our people who are caring, candid, and impact-driven to our business, which is innovative and rooted in...

  • Post-doctoral researcher Bioinformatics

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Universiteit Utrecht Voltijd

    Genomic surveillance of infectious diseases has been a game-changer in public health, shedding light on pathogen transmission, evolution, and source tracking. However, there is still much room for improvement in utilizing this data to comprehend the genetic factors behind pathogen success and virulence, and to make predictive...

  • Data Engineer

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland NZa Voltijd

    Data Engineer Ben jij een ervaren Data Engineering, Datawarehousing, ETL/ELT, Business Intelligence en data architectuur? Vind jij het een uitdaging om mee te werken in de transitie naar de cloud en een inspirerend nieuw data landschap op te zetten? Lees dan snel verder. Hoe ziet je werk als Data Engineer eruit? De NZa ontvangt en levert veel data van...

  • Data Engineer

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland NS Voltijd

    Data Engineer - Utrecht Utrecht uur Data & Technology Sluit op :00 DIA heeft een nieuw cloud based dataplatform voor alle databronnen van de NS. We zoeken een Data Engineer die kennis van tooling zoals Wherescape, Snowflake, en diverse Azure componenten mee neemt Data Engineer - Utrecht Utrecht Data & Technology uur Sluit op :00 Jij zorgt...

  • Research Officer in the Department of Medicine

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland HKU Voltijd

    Research Officer in the Department of Medicine, School of Clinical Medicine (Ref.: We now invite applications for the captioned post. Duties and Responsibilities join an active team of researchers in the development of bioinformatics and healthcare big data analysis and integrative mechanistic studies in a collaborative environment support clinical...

  • Data Engineer

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland NZa (Nederlandse Zorgautoriteit) Voltijd

    Ben jij een ervaren Data Engineer of Datawarehousing expert? Vind jij het een uitdaging om mee te werken in de transitie naar de cloud en een inspirerend nieuw data landschap op te zetten? Lees dan snel verder.

  • Data Engineer

    4 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland NZa (Nederlandse Zorgautoriteit) Voltijd

    Ben jij een ervaren Data Engineer of Datawarehousing expert? Vind jij het een uitdaging om mee te werken in de transitie naar de cloud en een inspirerend nieuw data landschap op te zetten? Lees dan snel verder.

  • Data Engineer

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Good Company Voltijd

    Leer de organisatie kennenDit internationale bedrijf is een frontrunner in Big Data, AI en Digital. Ze zorgen ervoor dat klanten - met behulp van data - innoveren, hun bedrijfsstrategie aansturen en de klantervaring verbeteren. Ze hebben een innoverende blik, genoeg expertise, goede service en een passie voor wat zij leveren. Zoals gezegd is het bedrijf...

  • Data Engineer Azure

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Bart Vink & Partners Voltijd

    BedrijfsomschrijvingWE.REPORT DATA CONSULTING is een onafhankelijk data adviesbureau uit Utrecht dat bedrijven adviseert over data- en AI-vraagstukken. De focus van onze data experts ligt op het ontwerpen en de bouwen van systemen voor zorgvuldige verzameling, opslag en analyse van gegevens. Bevlogenheid, kennis en daadkracht zijn eigenschappen van onze...

  • Data Engineer

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland ZET Company Voltijd

    De functie. Als Data Engineer bij onze klant in Utrecht bedenk, ontwerp en ontwikkel je technische oplossingen die het mogelijk maken om uit grote hoeveelheden data informatie te winnen, op te slaan en beschikbaar te maken om goede besluitvorming op te baseren. Deze data is afkomstig uit een grote diversiteit aan interne en externe offline en online...

  • 880 Data engineer

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Apollo IT Voltijd

    #880 Data engineer (NL-talig / Power BI / Azure data factory / verzekeringen) – Utrecht / hybride Voor onze eindklant in Utrecht zijn wij op zoek naar een freelance/ interim Data engineer met ervaring met Power BI en Azure data factory. Locatie: Utrecht (2 a 3 dagen, rest remote) Startdatum: ASAP, in de loop van januari Uren per week: 36 – 40 uur...

  • Data engineer

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Belastingdienst Voltijd

    Data engineer Het beheren en optimaliseren van verschillende bedrijfsprocessen is voor jou de weg naar efficiënter werken. Bij het Datafundamenten & Analytics (DF&A) van de Belastingdienst help je ons vanuit je rol als data engineer bij deze missie. Jij realiseert analytics-producten zoals risicomodellen en dashboards, zodat onze systemen vlekkeloos...

  • Azure Data Engineer

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland ilionx Voltijd

    Over deze functie Ben jij een gepassioneerde Data Engineer, die graag in teams samenwerkt om tot oplossingen te komen? En heb je verder een talent voor het bouwen van geavanceerde data oplossingen op een (Azure) Cloud platform? Dan is deze baan op jouw lijf geschreven Sluit je aan bij één van onze regionale datateams en werk namens ilionx aan projecten...

  • Internship, Data Engineering

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Genmab Voltijd

    At Genmab, we're committed to building extra[not]ordinary futures together, by developing antibody products and pioneering, knock-your-socks-off therapies that change the lives of patients and the future of cancer treatment and serious diseases. From our people who are caring, candid, and impact-driven to our business, which is innovative and rooted in...

  • Data Engineer Azure

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Bart Vink & Partners Voltijd

    BedrijfsomschrijvingWE.REPORT DATACONSULTING is een onafhankelijk data adviesbureau uit Utrecht datbedrijven adviseert over data- en AI-vraagstukken. De focus vanonze data experts ligt op het ontwerpen en de bouwen van systemenvoor zorgvuldige verzameling, opslag en analyse van gegevens.Bevlogenheid, kennis en daadkracht zijn eigenschappen van onzeexperts en...

  • Senior Engineer, Data Engineering

    2 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Good Company Voltijd

    Leer de organisatie kennen Dit internationale bedrijf is een frontrunner in Big Data, AI en Digital. Ze zorgen ervoor dat klanten - met behulp van data - innoveren, hun bedrijfsstrategie aansturen en de klantervaring verbeteren. Ze hebben een innoverende blik, genoeg expertise, goede service en een passie voor wat zij leveren. Zoals gezegd is het bedrijf...

  • Data engineer

    1 maand geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland De Rijksoverheid Voltijd

    Zorg voor beschikbaarheid van data vanuit een data platform waarmee scrumteams optimaal waarde kunnen leveren, voor een digitaal werkende RechtspraakAls data engineer in ons team ben je de steunpilaar voor het verbeteren en onderhouden van ons data platform. Jouw rol omvat niet alleen actieve betrokkenheid in het verfijnen van functionaliteit, maar ook het...