High Performance Computing

Team IT voor Onderzoek (ITvO) gaat een vernieuwende fase in. Sluit je aan bij een klein en dynamisch team, waar je je richt op de ontwikkeling en ondersteuning van de HPC-faciliteiten van de Vrije Universiteit.

Een werkdag van een HPC specialist? Die ziet er zo uit:

Het was een donderdagochtend toen Noah, High Performance Computing Specialist binnen het team IT voor Onderzoek (ITvO) van de Vrije Universiteit Amsterdam, de fiets parkeerde in de ondergrondse fietsenstalling naast het Nieuwe Universiteitsgebouw aan De Boelelaan. Een nieuwe werkdag stond op het punt te beginnen, gevuld met uitdagingen, teamwerk en complexe vraagstukken.

08:30 – Een rustige start

Noah startte de werkdag met een kop koffie, terwijl de computer opstartte. De eerste taak van de dag was het controleren van de status van het BAZIS HPC-cluster. Dit krachtige rekencluster wordt gebruikt door onderzoekers van verschillende faculteiten voor intensieve wetenschappelijke berekeningen, simulaties en data-analyses. Met diepgaande kennis van Linux en ervaring met het beheren van clusters, was dit een routineklus voor Noah, maar wel één die cruciaal was voor het waarborgen van een stabiele werkomgeving.

Noah logde in op de head node en voerde enkele shell scripts uit die automatisch de status van alle nodes binnen het cluster controleerden. Alles leek in orde, maar Noah zag dat een van de compute nodes trager presteerde dan normaal. Een interne analyse begon: een check op de logs en met kennis van monitoring tools om het probleem verder te onderzoeken.

09:15 – Probleemanalyse en oplossing

Na wat dieper graven, ontdekte Noah dat één van de nodes overbelast was door een gebruiker die een zeer intensieve simulatie had draaien. Dit veroorzaakte bottlenecks voor andere taken die tegelijkertijd uitgevoerd werden. Dankzij inzicht in en ervaring met performance analysis en optimalisatie, wist Noah snel dat de limieten van (tegelijkertijd) draaiende processen moesten worden aangepast om de belasting op het systeem te verlichten.

Noah paste de instellingen aan in Slurm, een veelgebruikte resourcemanager op HPC-clusters, en informeerde de betrokken onderzoeker over de wijzigingen. De onderzoeker werd ook uitgelegd hoe de taak in de toekomst efficiënter kon worden uitgevoerd door gebruik te maken van parallellisatie-technieken zoals MPI en OpenMP, en wellicht zelfs CUDA indien het rekenwerk zich ervoor leende.

10:30 – Samenwerken met onderzoekers

De rest van de ochtend stond in het teken van overleg met onderzoekers. Het onderzoeksteam bij Theoretische Chemie was bezig met Density Functional Theory simulaties en had advies nodig over het optimaliseren van hun code voor de GPU-accelerators op het cluster. Noah had veel ervaring met GPU-programming, vooral met NVIDIA CUDA en in iets mindere mate met OpenCL, en wist precies hoe hen te helpen.

Tijdens het overleg presenteerde het onderzoeksteam het ontwerp van de studie, terwijl Noah aantekeningen maakte. Na hun presentatie werd gedetailleerd advies gegeven over hoe ze hun code konden herschrijven om volledig te profiteren van de parallelle verwerkingskracht van de GPU’s. Ook werd uitgelegd hoe ze hun werk konden containeriseren met Docker of Singularity, zodat het mogelijk zou zijn om hun simulaties eventueel makkelijk te verhuizen naar Snellius, de Nederlandse nationale supercomputer, om die daar op nóg grotere schaal uit te voeren als dat nodig zou zijn.

12:00 – Lunch en informele gesprekken

Tijdens de lunch ontmoette Noah enkele collega's in de kantine. Het was een mix van IT Specialisten uit het eigen ITvO team en een aantal onderzoekers die het BAZIS cluster zeer intensief gebruikten. Het gesprek ging al snel over de nieuwste ontwikkelingen op het gebied van supercomputing en het gebruik van offloading naar de cloud voor HPC-taken. Noah had enige ervaring met HPC in de cloud en deelde inzichten over hoe het gebruik van cloud resources de universiteit kon helpen bij het schalen van hun rekencapaciteit, vooral tijdens piekperiodes.

13:00 – Projectwerk en documentatie

Na de lunch zat Noah weer aan het bureau en werkte verder aan een project. Noah was verantwoordelijk voor het uitbreiden van de opslagcapaciteit van het HPC-cluster. De universiteit had onlangs geïnvesteerd in een nieuw dataopslag platform met daarop een nieuwe parallelle filesystem oplossing. Noah was aangewezen door de teamleider om de implementatie op het HPC in goede banen te leiden. Noah werkte samen met het storage team van ITvO om de nieuwe opslag te integreren en ervoor te zorgen dat het naadloos zou samenwerken met de bestaande infrastructuur.

Noah documenteerde elk detail van het proces. Het was belangrijk dat alles goed vastgelegd werd, zodat collega’s en toekomstige HPC-specialisten gemakkelijk toegang hadden tot deze informatie. Technische documentatie was een essentieel onderdeel van het werk, en hoewel het soms tijdrovend was, wist Noah hoe belangrijk het was voor het succes van het team.

15:30 – Een onverwachte uitdaging

Terwijl Noah bezig was met het afronden van de documentatie, kwam een dringende e-mail van een onderzoeker van Bio-informatica. Er was een probleem met een grote dataset die niet correct op het cluster geplaatst kon worden. Dit soort problemen waren niet ongewoon, en Noah's analytische vaardigheden kwamen goed van pas bij het diagnosticeren van de oorzaak.

Na een grondige analyse ontdekte Noah dat het probleem te maken had met een haperende NFS-verbinding tussen de compute nodes en de opslagruimte. Dankzij de kennis van verschillende opslagoplossingen, kon er snel een oplossing geboden worden. Noah paste enkele NFS-parameters aan om herhaling te voorkomen en zorgde ervoor dat de onderzoeker het werk zonder verdere problemen kon hervatten.

17:00 – Afronden van de dag

Tegen het einde van de dag checkte Noah nog een laatste keer de status van het cluster. Alles draaide soepel en de problemen die eerder op de dag waren opgetreden, waren allemaal opgelost. Voor vertrek, maakte Noah een korte notitie voor het teamoverleg van maandag, waarin de resultaten van de performance analyses en de voortgang van de opslaguitbreiding zijn samengevat.

Met een tevreden gevoel stapte Noah naar buiten, klaar om de dag achter zich te laten. Morgen zou weer een nieuwe dag vol uitdagingen en samenwerking zijn, iets om naar uit te kijken. Als HPC Specialist bij de Vrije Universiteit Amsterdam heeft het werk een directe impact had op het succes van wetenschappelijk onderzoek, en dat gaf iedere dag opnieuw voldoening.

Achtergrond

• Bachelor- of masterdiploma in informatica, wiskunde, natuurkunde, data science, ingenieurswetenschappen, of een verwant vakgebied.
• Academisch werk-denkniveau / kandidaten met meerdere jaren werkervaring in het vakgebied in plaats van bovengenoemde zijn ook zeer welkom om te solliciteren

Besturingssystemen & Software

• Diepgaande kennis van Linux/Unix systemen, vooral in de context van serverbeheer.
• Ervaring met Shell scripting voor automatisering en beheer van taken.
• Kennis en ervaring met met parallelle en distributed programming m.b.v. MPI, OpenMP, CUDA, etc.
• Kennis van containerisatie en virtualisatie (zoals Singularity)

Clustermanagement

• Ervaring met het opzetten (pré) / beheren van HPC-clusters (kennis van resourcemanagers zoals Slurm, PBS, etc.)
• Ervaring met monitoring en optimalisatie van cluster performance.

Hardware, storage en netwerken

• Kennis van high-speed netwerkarchitecturen (zoals Infiniband (pré)) en storagetechnologieën zoals parallelle bestandssystemen (zoals BeeGFS, Lustre, GPFS).
• Kennis van opslagoplossingen (SAN, DAS storage, etc.), en fine-t

Als universiteit streven we naar gelijke kansen voor iedereen, in het besef dat diversiteit vele vormen kent. Wij geloven dat diversiteit in al haar complexiteit van onschatbare waarde is voor de kwaliteit van ons onderwijs, onderzoek en onze dienstverlening. We zijn altijd op zoek naar talent met diverse achtergronden en ervaringen. Dat betekent ook dat we ons inzetten voor het creëren van een inclusieve gemeenschap, zodat we diversiteit als meerwaarde kunnen benutten.

We beseffen dat elk individu een unieke set aan vaardigheden, expertise en denkwijze met zich meebrengt. We nodigen dan ook graag iedereen uit die zich herkent in het profiel om te solliciteren, zelfs als je niet aan alle eisen voldoet.

Een uitdagende functie bij een maatschappelijk betrokken organisatie. Bij de VU draag je bij aan onderwijs, onderzoek en dienstverlening voor een betere wereld. En daar mag wat tegenover staan. Daarom bieden wij jou:

• Een salaris van minimaal € 3.226,00 (Schaal 10) en maximaal € 5.090,00 (Schaal 10) bruto per maand, bij een voltijds dienstverband. Dit is gebaseerd op het UFO-profiel Beheerder ICT 2. Het precieze salaris hangt af van je opleiding en ervaring.
• Een functie voor minstens 0,8 fte. Je arbeidsovereenkomst duurt in eerste instantie 1 jaar, met intentie tot verlengen naar vast dienstverband.

Daarnaast bieden wij je aantrekkelijke secundaire arbeidsvoorwaarden en regelingen. Enkele voorbeelden:

• Bij een voltijdse 38-urige werkweek hoort een vakantietegoed van 232 uur per jaar. Als je ervoor kiest om 40 uur te werken, beschik je op jaarbasis over 96 extra vakantie-uren. Bij een deeltijdaanstelling wordt dit naar rato berekend.
• 8% vakantietoeslag en 8,3% eindejaarsuitkering
• hybride werken maakt een goede werk/privébalans mogelijk (tenminste 50% aanwezigheid op de VU)
• ruimte voor persoonlijke ontwikkeling
• mogelijkheid tot sparen van vakantiedagen, bijvoorbeeld voor sabbatical leave

De Vrije Universiteit (VU) biedt wetenschappers en onderzoekers een (high-end) onderzoeksinfrastructuur aan. Het team IT voor Onderzoek (ITvO) ondersteunt onderzoek door het bieden van storage oplossingen, HPC diensten en ondersteuning en advies in het toepassen daarvan. IT voor Onderzoek gaat een vernieuwende fase in en zoekt meerdere getalenteerde collega’s om het team te versterken en samen ITvO een nieuw impuls te geven.

Jouw inzet zal onze koers bepalen terwijl we innoveren en groeien. Ben jij klaar om deel uit te maken van IT voor onderzoek voor de toekomst? Solliciteer dan direct of kom eerst een (digitaal) kopje koffie doen. De vacature sluit zodra wij een juiste match hebben, dus twijfel niet om te reageren

Welkom bij de dienst Informatietechnologie
Als dienst Informatietechnologie (IT) zorgen we ervoor dat onderzoekers, medewerkers en studenten probleemloos kunnen werken en studeren. We faciliteren onderwijs en onderzoek met IT-middelen, adviseren over IT-producten en -diensten en houden het applicatielandschap up-to-date. Zo zorgen we ervoor dat de IT-voorzieningen van de universiteit 24/7 beschikbaar zijn.

Tegelijkertijd ligt onze focus bij de digitale toekomst: van de slimme campus tot cybersecurity, van open science tot artificial intelligence. Met faculteiten en diensten kijken we voortdurend vooruit: hoe kunnen we nú al klaar zijn voor de vragen van morgen? Samen vinden we nieuwe manieren om de VU-ambities op het gebied van onderwijs, onderzoek en valorisatie nóg beter te ondersteunen.

Kom je werken bij IT? Dan werk je in een complex, vaak hectisch en uitdagend speelveld, met aandacht voor zowel ontwikkeling als beheer. Bij ons krijg je alle ruimte om initiatief te tonen en verantwoordelijkheid te nemen. We vinden het belangrijk om van elkaar te leren, altijd met de focus op resultaat. Bij IT werk je samen met ruim 200 collega’s, verdeeld over 4 afdelingen.

Vrije Universiteit Amsterdam
De Vrije Universiteit Amsterdam staat voor waardengedreven onderwijs en onderzoek. Wij zijn vrije denkers met kennis van zaken en een open houding – a broader mind. Met een ondernemende aanpak en aandacht voor diversiteit, zingeving en medemenselijkheid werken wij aan duurzame oplossingen met maatschappelijke impact. Door onze krachten te bundelen, over de grenzen van vakgebieden heen, werken we aan een betere wereld voor mens en planeet. Samen creëren we een veilig en respectvol werk- en studieklimaat, en een inspirerende omgeving voor onderwijs en onderzoek. Lees meer over onze gedragscodes.

We zijn gevestigd op één fysieke campus, in het hart van de Amsterdamse Zuidas, met een uitstekende ligging en bereikbaarheid. Aan de VU werken ruim 6.150 medewerkers en volgen ruim 31.000 studenten wetenschappelijk onderwijs.

Diversiteit
Diversiteit is een speerpunt van de VU. De VU wil toegankelijk en ontvankelijk zijn voor diversiteit in vakgebieden, culturen, ideeën, nationaliteiten, overtuigingen, voorkeuren en levensbeschouwingen. Vanuit vertrouwen, respect en interesse leiden verschillen hier tot nieuwe inzichten en innovatie, tot scherpte en helderheid, tot excellentie en een ruimer begrip.

Wij staan voor een inclusieve gemeenschap en geloven dat diversiteit en internationalisering bijdragen aan de kwaliteit van onderwijs, onderzoek en onze dienstverlening.

We zijn dan ook voortdurend op zoek naar mensen die door hun achtergrond en ervaring bijdragen aan de diversiteit van de VU-gemeenschap.

Ben jij geïnteresseerd in deze functie en ben jij van mening dat jouw ervaring bijdraagt aan de kwaliteit van onze dienstverlening? Dan nodigen wij je graag uit om te solliciteren, ook als je niet aan alle eisen voldoet.

Het overleggen van een diploma en Verklaring Omtrent Gedrag (VOG) maken onderdeel uit van de sollicitatieprocedure.

Sollicitaties ontvangen per e-mail worden niet in behandeling genomen.

Acquisitie naar aanleiding van deze advertentie wordt niet op prijs gesteld.