Nlp Expert in Molecular Life Sciences

6 maanden geleden

Utrecht, Nederland TNO Voltijd

**Over deze vacature**:

- Als NLP Expert in Molecular Life Sciences wordt je onderdeel van de afdeling RAPID. RAPID is een onderzoeksgroep die zich richt op de beoordeling van gezondheidsrisico’s van producten in ontwikkeling. RAPID bestudeert de effecten van mogelijke blootstellingen aan gevaarlijke stoffen uit verschillende bronnen en omgevingen, zoals werkplekken, algemene omgeving en voedsel of medicijnen. RAPID heeft ongeveer 50 wetenschappers in dienst met expertise in diverse gebieden, zoals toxicologie, epidemiologie, blootstellingsleer, chemie, arbeidshygiëne en statistiek.
- Deze wetenschappers gebruiken risicoanalyse, statistische expertise en experimenteel onderzoek om innovatieve, wetenschappelijk onderbouwde instrumenten, modellen en methoden te ontwikkelen om de risico’s te voorspellen en te verminderen. Het doel van RAPID is om de gezondheid van de mensen te verbeteren door het verminderen van de blootstelling aan gevaarlijke stoffen. Ze doen dit door actief bij te dragen aan activiteiten zoals het adviseren over preventieve maatregelen, het toepassen van veilige en duurzame ontwerpprincipes voor producten en processen, en het leveren van bruikbare kennis voor beleidsmakers en andere belanghebbenden. RAPID werkt samen met universiteiten, onderzoeksinstituten, overheden en industriële partners.**Wat ga je doen?**:

- Een van de onderzoekslijnen binnen de afdeling RAPID is gericht op de ontwikkeling van innovatieve oplossingen op basis van tekst
- en datamining ter ondersteuning van moleculair onderzoek. Voorbeelden hiervan zijn de ontwikkeling van het webgebaseerde platform TargetTri ter ondersteuning van drug target profiling, de toepassing van Large Language Models (LLM's) om data-gedreven target identificatie en training uit te voeren en het toepassen van LLM's ter ondersteuning van de ontwikkeling van proefdiervrije methodologieën en het analyseren van hun translationele waarde.
- Als NLP Expert in Molecular Life Sciences werk je samen met een team van ontwikkelaars en biomedische experts, afhankelijk van het project. Je maakt ook deel uit van een afdelingsoverschrijdend team van datawetenschappers.
- #LI-Hybrid
- Jouw kernactiviteiten zijn:
- Ontwikkelen en toepassen van NLP-modellen ter ondersteuning van verschillende aspecten van biomedische resultaten;
- Creatie en curatie van trainings
- en testsets die nodig zijn voor de ontwikkeling van nieuwe NLP-modellen;
- Bepalen van relevantie en bruikbaarheid van bestaande LLM's voor specifieke onderzoeksvragen;
- Brede kijk op NLP en het vermogen om te adviseren over de geschiktheid van text-mining methoden;
- Relevante informatie extraheren uit openbare databases en andere bronnen volgens interne normen voor gegevensverwerking;
- Samenstellen en communiceren van onderzoeksresultaten in wetenschappelijke publicaties, presentaties van wetenschappelijke congressen en interne TNO-rapporten;
- Participeren in (multidisciplinaire) onderzoeksprojecten en in wetenschappelijke discussies met (internationale) experts uit diverse vakgebieden zowel binnen TNO als in (inter)nationale projecten;
- Deelnemen aan het schrijven van interne en externe projectvoorstellen voor onderzoek.

**Wat wij van jou verwachten**:

- We zijn op zoek naar een NLP Expert die naast ervaring in NLP en Text Mining ook een wetenschappelijke achtergrond heeft in Molecular Life Science, Farmacie en/of Drug Discovery. Deze biomedische kennis gebruik je om het ontwerp van onze NLP oplossingen te sturen en te optimaliseren.
- Je herkent je kort gezegd in een groot deel van deze punten:
- Wetenschappelijk expertise in biomedische wetenschappen, bijv. farmaceutische wetenschap, moleculaire wetenschappen of drug discovery;
- Ervaring met NLP-tools zoals NLTK, SpaCy en HuggingFace;
- Ervaring met LLMs zoals bijv BERT en ChatGPT en specifiek in LLM finetuning;
- Ervaring met het analyseren van ongestructureerde tekstuele datasets en toepassing van text-miningtechnieken (bijv. Named Entity Extraction, Relation Extraction, Text Classification, enz.);
- Ervaring met andere soorten (big) data-analyses (bijv.: bouwen van kennisgrafieken);
- Sterke vaardigheden en ervaring in relevante programmeertalen (Python);
- Uitstekende mondelinge en schriftelijke communicatieve vaardigheden in het Engels;
- Beschikbaarheid van 32-40 uur per week.

**Wat wij jou bieden**:

- Uitdagend én afwisselend werk met serieuze impact. En volop kansen, want bij TNO heb je grotendeels zelf de regie over je carrière. Naast een bruto (fulltime) maandsalaris tussen € 3.950;
- en € 6.500;
- (afhankelijk van je kennis en ervaring), vakantiegeld (8%), een dertiende maand (8,33%) en een flexbudget (5,58% + €180), krijg je alle mogelijkheden om jezelf te ontwikkelen.
- Daarnaast kun je bij TNO een ‘menu’ aan arbeidsvoorwaarden samenstellen dat bij jouw persoonlijke situatie past. Wat je ook mag verwachten:
- Een uiterst professionele, innovatieve werkomgeving, met topexperts als collega’s.
- Mogelijkh

  • Intern, Cell

    1 maand geleden

    Utrecht, Nederland Genmab Voltijd

    At Genmab, we’re committed to building extra[not]ordinary futures together, by developing antibody products and pioneering, knock-your-socks-off therapies that change the lives of patients and the future of cancer treatment and serious diseases. From our people who are caring, candid, and impact-driven to our business, which is innovative and rooted in...

  • Phd Position: Molecular Mechanisms of Protein

    6 maanden geleden

    Utrecht, Nederland Universiteit Utrecht Voltijd

    **Your job**: We are working at the interface of biochemistry, molecular biology and biophysics to follow the journey of nascent proteins toward their functional structures as they emerge from the ribosome. These mechanistic studies pave the way for targeted interventions against protein misfolding and perturbed protein homeostasis which are important for a...

  • Biomedical Data Scientist

    6 maanden geleden

    Utrecht, Nederland TNO Voltijd

    **Over deze vacature**: - RAPID is een onderzoeksgroep die zich richt op de beoordeling van gezondheidsrisico’s van producten in ontwikkeling. RAPID bestudeert de effecten van mogelijke blootstellingen aan gevaarlijke stoffen uit verschillende bronnen en omgevingen, zoals werkplekken, algemene omgeving en voedsel of medicijnen. RAPID heeft ongeveer 50...

  • NLP AI Expert

    4 weken geleden

    Utrecht, Nederland Matchd Voltijd

    Vacaturebeschrijving OpdrachtomschrijvingKVK is op zoek naar een interim senior NLP AI Expert:Als Senior NLP AI Expert werk je aan innovatieve AI-oplossingen die het voor ondernemers gemakkelijker maken om hun bedrijfsactiviteiten nauwkeurig te beschrijven bij het opzetten van een eenmanszaak;Je draagt bij aan de ontwikkeling van de invoerhulp, die KVK's...

  • NLP AI Expert

    4 weken geleden

    Utrecht, Provincie Utrecht, Nederland Matchd Voltijd

    Vacaturebeschrijving OpdrachtomschrijvingKVK is op zoek naar een interim senior NLP AI Expert:Als Senior NLP AI Expert werk je aan innovatieve AI-oplossingen die het voor ondernemers gemakkelijker maken om hun bedrijfsactiviteiten nauwkeurig te beschrijven bij het opzetten van een eenmanszaak;Je draagt bij aan de ontwikkeling van de invoerhulp, die KVK's...

  • NLP AI Expert

    4 weken geleden

    Utrecht, Nederland Matchd Voltijd

    Vacaturebeschrijving OpdrachtomschrijvingKVK is op zoek naar een interim senior NLP AI Expert:Als Senior NLP AI Expert werk je aan innovatieve AI-oplossingen die het voor ondernemers gemakkelijker maken om hun bedrijfsactiviteiten nauwkeurig te beschrijven bij het opzetten van een eenmanszaak;Je draagt bij aan de ontwikkeling van de invoerhulp, die KVK's...

  • Molecular Biologist Intern

    1 maand geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Genmab Voltijd

    Internship OpportunityWe're committed to building extraordinary futures together, by developing antibody products and pioneering therapies that change lives of patients and the future of cancer treatment and serious diseases.Position OverviewOur Cell and Molecular Sciences team is seeking an intern to assist in the design and execution of experiments using...

  • PhD Position in Fair and Robust NLP Research

    4 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Universiteit Utrecht Voltijd

    About the OpportunityAs a PhD candidate at Universiteit Utrecht, you will contribute to groundbreaking research in Natural Language Processing (NLP) and help develop more fair and robust models. The DataDivers project, funded by an ERC Starting grant, aims to improve data quality and collection methods for NLP.Your RoleYou will work closely with the project...

  • PhD position on Data Diversity for Fair and Robust NLP

    1 maand geleden

    Utrecht, Nederland Universiteit Utrecht Voltijd

    Dive into data diversity to make Natural Language Processing (NLP) models more fair and robust!Are you passionate about fair and robust Natural Language Processing (NLP), data, and computational social science/sociolinguistics? Join our new ambitious DataDivers project funded by an ERC Starting grant and help us make NLP models more fair and robust.Your...

  • Molecular Biologist Intern Opportunity for Innovation and Growth

    4 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Genmab Voltijd

    Genmab, a leading biotechnology company, offers an exciting opportunity for a Molecular Biologist to join our dynamic Cell and Molecular Sciences team as an intern.About GenmabWe are committed to improving the lives of patients through innovative and differentiated antibody therapeutics. Our passionate team has invented next-generation antibody technology...

  • Phd Position in Molecular Control of

    6 maanden geleden

    Utrecht, Nederland Universiteit Utrecht Voltijd

    The immune system helps plants resist pathogen infections and has been well studied. However, it becomes increasingly clear that enhancing defense comes at a cost, as plants slow down growth even if the infection is successfully combatted. In this project, you will investigate how plants control their growth during and after an immune response. This research...

  • Research Associate, High Throughput Molecular Tools

    6 maanden geleden

    Utrecht, Nederland Genmab Voltijd

    At Genmab, we’re committed to building extra[not]ordinary futures together, by developing antibody products and pioneering, knock-your-socks-off therapies that change the lives of patients and the future of cancer treatment and serious diseases. From our people who are caring, candid, and impact-driven to our business, which is innovative and rooted in...

  • Academic Researcher in Biomedical Sciences

    4 weken geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland HKU Voltijd

    HKU invites applications for Tenure-Track Associate Professor/Assistant Professor positions to contribute to the School of Biomedical Sciences.Job OverviewThe appointees will participate in teaching biomedical sciences subjects relevant to human health and diseases, spanning basic biochemical, cellular and molecular biology to whole body organization and...

  • Technician (Molecular Biology)

    3 maanden geleden

    Utrecht Oost, Nederland GenDx Voltijd

    **GenDx, experts in transplant diagnostics** GenDx is a global leader in molecular diagnostic laboratory solutions for high resolution tissue typing of both donors and patients and monitoring transplant success. We combine our cutting-edge software solutions, reagents for DNA sequencing-based HLA typing and Chimerism monitoring strategies with our excellent...

  • Phd Position in Molecular Control of

    6 maanden geleden

    Utrecht, Nederland Universiteit Utrecht Voltijd

    The immune system helps plants resist pathogen infections and has been well studied. However, it becomes increasingly clear that enhancing defense comes at a cost, as plants slow down growth even if the infection is successfully combatted. In this project, you will investigate the poorly understood process of how plants control their growth during and after...

  • Antibody Discovery Expert

    10 uur geleden

    Utrecht, Utrecht, Nederland Genmab Voltijd

    Unlock the Future of Cancer TreatmentInnovative minds are required to push the boundaries of antibody-based therapies. As an Antibody Discovery Expert, you will join our team in Utrecht, Netherlands, for a 7-9 month internship or graduation project.About the RoleWe are seeking a highly motivated MSc student with a passion for biomedical sciences, molecular...

  • Phd Position On Data Diversity for Fair and Robust

    1 maand geleden

    Utrecht Oost, Nederland Universiteit Utrecht Voltijd

    Are you passionate about fair and robust Natural Language Processing (NLP), data, and computational social science/sociolinguistics? Join our new ambitious DataDivers project funded by an ERC Starting grant and help us make NLP models more fair and robust. **Your job**: The rise of Large Language Models (LLMs) and the availability of massive datasets have...

  • Postdoctoral Researcher in Molecular Hematology

    6 maanden geleden

    Utrecht, Nederland Prinses Máxima Centrum Voltijd

    We are seeking a highly motivated and talented Postdoctoral Researcher to join our team and contribute to our ongoing projects in molecular hematology. **Research focus** You will play a key role in the design and implementation of _in vitro_ culture models using primary human hematopoietic cells, with a particular emphasis on single-cell genomics...

  • Post-doctoral Fellow in the School of Biomedical Sciences

    7 maanden geleden

    Utrecht, Nederland HKU Voltijd

    Applications are invited for appointment as Post-doctoral Fellow in the School of Biomedical Sciences (Ref.: 524274), to commence as soon as possible for one year with possibility of renewal subject to satisfactory performance. Applicants should have a Ph.D. degree in a biological biomedical, or related field, with experience in molecular and cell...

  • Bioinformatician Drost Group

    3 weken geleden

    Utrecht Oost, Nederland Prinses Máxima Centrum Voltijd

    Within our team, we currently have an opening for a computational biologist with a MSc in Life Sciences, Engineering, Computer Science, Information Systems, or equivalent. We offer a multidisciplinary research atmosphere, which combines bioinformatics, functional genomics, and stem cell biology. **The project** As a bioinformatician in our group, your key...